Resumen. Las taupatías son un grupo de enfermedades neurodegenerativas que presentan agregados de la proteína tau en diferentes regiones cerebrales. Recientes estudios han reportado una distribución de tau en parches o “islas” a lo largo de la neurona. Sin embargo, la localización a nivel nanoscópico sigue siendo desconocida. Debido a esto, se aplicó la técnica de microscopía de superresolución iPALM (Interferometric Photoactivation and Localization Microscopy) para determinar la distribución de tau en neuronas derivadas de células madre humanas (i3Neurons). Esta técnica posee una resolución de ~20 nm, superando ampliamente la resolución de las microscopías ópticas estándares que se encuentran limitadas por difracción (~200 nm). Las imágenes obtenidas muestran una distribución heterogénea de la proteína, presente a lo largo de toda la neurona. El objetivo de este trabajo es determinar si su localización es distinta en diferentes regiones intracelulares, a partir del análisis cuantitativo de los datos suministrados por iPALM: matriz de posiciones de cada partícula (x,y,z).
Palabras clave. Neuronas-microscopía-clustering-localización.
Conocimientos deseables. Técnicas de clustering y programación básica.
¿Qué podría aprender quien realice esta tesis? – Trabajará con datos reales (localización x,y,z de proteínas en neuronas) obtenidos con técnicas avanzadas de microscopía de un sistema de relevancia biomédica. Esto le permitirá conocer de primera mano las herramientas que utilizan biólogo/as y biofísica/os y comprender las hipótesis de trabajo en la investigación básica. También se enfrentará al desafío de utilizar herramientas para el análisis cuantitativo y la visualización de los datos
Dirección de la tesis
Bruno, Luciana
Instituto de Cálculo
Contacto: lucianabrun@gmail.com
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Herramientas cuantitativas para el análisis de datos de localización de proteínas obtenidos por microscopía de superresolución