15/12/2025
Procesado de imágenes de microscopía light-sheet en el cerebro del ratón
Verónica Pérez Schuster
Resumen
En el laboratorio de neurogénesis experimental estamos buscando tesista de ciencia de datos. Estudiamos el efecto de los antidepresivos en una etapa temprana del desarrollo postnatal en modelo de ratón. Realizamos test de memoria espacial y posteriormente extraemos cerebros para estudiar su activación neuronal. Para ello realizamos inmunofluorescencia con el fin de detectar un gen de expresión temprana, cFos. Contamos imágenes del encéfalo en tres dimensiones adquiridas con un microscopio de fluorescencia lighsheet, el cual permite obtener información del tejido entero, sin necesidad de cortarlo en secciones. Para realizar la cuantificación de cFOS en células de todo el cerebro, el procesado de las imágenes deberá realizarse comparando distintas regiones, lo cual implica gran complejidad del análisis y requiere de amplio manejo de programación y computación. El objetivo del proyecto será poner a punto el análisis de las adquisiciones obtenidas, empleando conocimientos en ciencia de datos.
Descripción de la propuesta
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Conocimientos deseables
manejo de imagenes en python, idealmente haber cursado ibmc.
Qué aprenderá el o la estudiante
Durante la tesis se aprendera a realizar análisis de imágenes en el marco de neurociencia, se tienen datos de microscopia ligth-sheet de todo el cerebro del ratón y se requiere reconstruir y comparar el resultado de las imágenes entre dos condiciones distintas.
